Nộp lại tờ khai thuế giá trị gia tăng có bị phạt không? Những lưu ý cho doanh nghiệp

Nộp lại tờ khai thuế giá trị gia tăng có bị phạt không là thắc mắc của nhiều doanh nghiệp. Bài viết giải thích chi tiết theo luật thuế 2025, hướng dẫn cách kê khai, nộp bổ sung hồ sơ GTGT đúng quy định. Đồng thời, cung cấp cách tránh sai sót, giảm rủi ro bị xử phạt hành chính, giúp kế toán và doanh nghiệp kiểm soát thuế hiệu quả. Cập nhật thông tin mới nhất, dễ áp dụng cho mọi loại hình doanh nghiệp.

1. Tổng quan thuế giá trị gia tăng

1.1 Khái niệm thuế giá trị gia tăng (GTGT)

Thuế Giá trị gia tăng (GTGT) là loại thuế gián thu đánh vào giá trị gia tăng của hàng hóa, dịch vụ phát sinh trong từng giai đoạn sản xuất, kinh doanh. Khác với thuế trực thu, thuế GTGT không đánh trực tiếp vào thu nhập của người sản xuất, kinh doanh, mà được tính vào giá bán, do người tiêu dùng cuối cùng chi trả.

Nguyên tắc tính thuế GTGT:

+ Doanh nghiệp được khấu trừ thuế GTGT đầu vào (thuế đã nộp khi mua hàng hóa, dịch vụ) khỏi thuế GTGT đầu ra (thuế thu từ bán hàng).

+ Số thuế GTGT phải nộp cơ quan thuế = Thuế GTGT đầu ra – Thuế GTGT đầu vào được khấu trừ.

Ví dụ thực tế:
Doanh nghiệp mua nguyên vật liệu trị giá 100 triệu đồng, thuế GTGT 10% = 10 triệu đồng. Khi bán sản phẩm với giá 200 triệu đồng, thuế GTGT 10% = 20 triệu đồng. Số thuế GTGT phải nộp cơ quan thuế = 20 triệu – 10 triệu = 10 triệu đồng.

1.2 Đặc điểm thuế giá trị gia tăng (GTGT)

Thuế giá trị gia tăng (VAT) có 4 đặc điểm đặc trưng sau:

+ Thuế gián thu

+ Thuế tiêu dùng nhiều giai đoạn không trùng lặp

+ Đánh thuế theo nguyên tắc điểm đến

+ Phạm vi điều tiết rộng

1.2.1 Thuế GTGT là thuế gián thu – khách hàng cuối cùng trả tiền

Khác với thuế trực thu đánh vào lợi nhuận doanh nghiệp, thuế GTGT là thuế gián thu, nghĩa là người tiêu dùng cuối cùng chịu thuế. Doanh nghiệp chỉ là người nộp thay.

Ví dụ thực tế:
Một cửa hàng bán quần áo nhập về có giá 500.000 đồng, GTGT 10% là 50.000 đồng. Khách hàng mua sẽ thanh toán 550.000 đồng, nhưng phần 50.000 đồng này chính là thuế GTGT mà cửa hàng sẽ nộp cơ quan thuế. Nhờ vậy, kế toán dễ dàng theo dõi và kê khai thuế GTGT đầy đủ.

Điều này cũng nhấn mạnh tầm quan trọng của việc kê khai thuế GTGT chính xác, vì số thuế doanh nghiệp nộp phản ánh trực tiếp nghĩa vụ với nhà nước.

1.2.2 Thuế GTGT áp dụng nhiều giai đoạn nhưng không trùng lặp

Một đặc điểm thú vị của thuế GTGT là tính theo giá trị gia tăng mới của mỗi giai đoạn, không tính trùng với thuế đã nộp trước đó. Điều này giúp doanh nghiệp không phải trả thuế hai lần cho cùng một giá trị.

Ví dụ minh họa:

+ Nguyên liệu trị giá 100 triệu đồng, GTGT đầu vào 10 triệu đồng.

+ Sản phẩm hoàn thiện bán ra 200 triệu đồng, GTGT đầu ra 20 triệu đồng.

+ Số thuế GTGT phải nộp: 20 – 10 = 10 triệu đồng.

Nhờ nguyên tắc này, doanh nghiệp có thể nộp tờ khai thuế GTGT chính xác, vừa hợp pháp vừa tối ưu chi phí thuế.

1.2.3 Thuế GTGT theo nguyên tắc điểm đến – mọi hàng hóa tiêu dùng trong nước đều chịu thuế

Thuế GTGT được áp dụng theo nguyên tắc điểm đến, nghĩa là tất cả hàng hóa, dịch vụ tiêu dùng trong nước, bất kể được sản xuất trong nước hay nhập khẩu, đều phải kê khai và nộp thuế GTGT.

Điều này đảm bảo sự công bằng giữa hàng nội địa và hàng nhập khẩu, đồng thời giúp doanh nghiệp xuất nhập khẩu theo dõi và kê khai thuế GTGT đúng luật, tránh sai sót khi nộp tờ khai.

1.2.4 Thuế GTGT có phạm vi điều chỉnh rộng – ảnh hưởng đến mọi doanh nghiệp

Thuế GTGT là thuế tiêu dùng phổ biến, áp dụng cho hầu hết hàng hóa và dịch vụ. Không chỉ là nguồn thu quan trọng cho ngân sách, GTGT còn ảnh hưởng trực tiếp đến chiến lược giá bán và kế hoạch kinh doanh.

Nếu doanh nghiệp kê khai thuế GTGT đúng, việc nộp tờ khai thuế GTGT sẽ suôn sẻ, tránh rủi ro phạt vi phạm hành chính và giúp kế toán quản lý dòng tiền hiệu quả.

1.3 Vai trò của thuế giá trị gia tăng

Thuế GTGT (VAT) không chỉ là nghĩa vụ tài chính mà còn rất quan trọng trong quản lý kinh tế và kế toán doanh nghiệp. Thuế giá trị gia tăng có các vai trò chính như sau:

+ Tạo nguồn thu ổn định cho ngân sách nhà nước.

+ Khuyến khích xuất khẩu hàng hóa, dịch vụ.

+ Thúc đẩy hạch toán và sử dụng hóa đơn minh bạch.

+ Điều tiết tiêu dùng của tổ chức, cá nhân.

2. Nộp lại tờ khai thuế giá trị gia tăng có bị phạt không?

Khi khai sai hồ sơ thuế, nhiều doanh nghiệp lo lắng sẽ bị xử phạt. Tuy nhiên, theo khoản 3 Điều 9 Nghị định 125/2020/NĐ-CP, nếu người nộp thuế thực hiện các bước sau thì không bị xử phạt:

+ Khai bổ sung hồ sơ khai thuế kịp thời trước khi cơ quan thuế phát hiện sai sót.

+ Tự giác nộp đủ số thuế phải nộp, bao gồm GTGT hoặc các loại thuế khác.

+ Hoàn thành các bước trên trước khi cơ quan thuế công bố quyết định kiểm tra, thanh tra tại trụ sở doanh nghiệp hoặc trước khi cơ quan có thẩm quyền khác phát hiện.

Lợi ích khi nộp bổ sung hồ sơ khai thuế:

+ Đảm bảo kê khai thuế GTGT chính xác và minh bạch.

+ Giữ uy tín với cơ quan thuế, tránh rủi ro bị phạt vi phạm hành chính.

+ Giúp kế toán kiểm soát số liệu, rà soát thuế đầu vào và đầu ra, tối ưu dòng tiền cho doanh nghiệp.

Điều này có nghĩa là doanh nghiệp vẫn có thể chỉnh sửa tờ khai thuế GTGT, kê khai bổ sung thuế thu nhập hay thuế khác mà không lo bị phạt, miễn là thực hiện chủ động và đã tự giác nộp đủ số tiền thuế phải nộp trước thời điểm cơ quan thuế công bố quyết định kiểm tra thuế. Và nộp tờ khai thuế GTGT bổ sung kịp thời là cách hiệu quả để tuân thủ pháp luật và bảo vệ quyền lợi tài chính của doanh nghiệp.

3. Thời hạn nộp bổ sung hồ sơ khai thuế

Khi phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp có sai sót, doanh nghiệp hoặc kế toán có thể khai bổ sung hồ sơ khai thuế mà không lo bị phạt nếu thực hiện đúng thời hạn và quy định pháp luật. Theo Điều 47 Luật Quản lý thuế 2019 (sửa đổi 2024):

+ Thời hạn nộp bổ sung: Người nộp thuế được khai bổ sung trong vòng 10 năm kể từ ngày hết hạn nộp hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế có sai sót.

+ Điều kiện áp dụng:

– Thực hiện trước khi cơ quan thuế hoặc cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra, thanh tra;

– Hồ sơ khai thuế không thuộc phạm vi hoặc thời kỳ thanh tra, kiểm tra thuế nêu trong quyết định thanh tra, kiểm tra;

– Với những nội dung thuộc phạm vi thanh tra, kiểm tra, doanh nghiệp phải bổ sung bản giải trình và các tài liệu liên quan theo yêu cầu.

+ Hồ sơ khai bổ sung gồm:

– Tờ khai bổ sung;

– Bản giải trình khai bổ sung cùng các tài liệu, chứng từ liên quan.

+ Đối với hàng hóa xuất nhập khẩu: Việc khai bổ sung hồ sơ khai thuế được thực hiện theo quy định của pháp luật hải quan.

Lưu ý quan trọng:  Khi phát hiện hồ sơ khai thuế GTGT đã nộp có sai sót, người nộp thuế được khai bổ sung hồ sơ trong thời hạn 10 năm kể từ ngày hết hạn nộp hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế liên quan.

4. Mức phạt và cách xử lý khi khai sai thuế GTGT

Khi doanh nghiệp hoặc cá nhân khai sai hồ sơ thuế GTGT nhưng không thiếu số tiền thuế phải nộp, pháp luật vẫn có quy định xử phạt vi phạm hành chính. Theo Điều 12 Nghị định 125/2020/NĐ-CP:

(1) Mức phạt đối với hành vi khai sai không liên quan đến nghĩa vụ thuế:

+ 500.000 – 1.500.000 đồng đối với khai sai, khai thiếu chỉ tiêu trong hồ sơ thuế nhưng không liên quan đến xác định nghĩa vụ thuế.

+ 1.500.000 – 2.500.000 đồng đối với khai sai, thiếu chỉ tiêu trên tờ khai thuế hoặc phụ lục kèm theo nhưng không liên quan đến nghĩa vụ thuế.

+ 5.000.000 – 8.000.000 đồng đối với các hành vi:

– Khai sai, thiếu chỉ tiêu liên quan đến xác định nghĩa vụ thuế;

– Hành vi theo khoản 3 Điều 16 hoặc khoản 7 Điều 17 Nghị định 125/2020/NĐ-CP.

(2) Biện pháp khắc phục:

+ Buộc khai lại và nộp bổ sung các tài liệu trong hồ sơ thuế đối với các hành vi khai sai nêu trên;

+ Buộc điều chỉnh lại số lỗ hoặc thuế GTGT đầu vào được khấu trừ chuyển kỳ sau nếu có.

Lưu ý:

+ Mức phạt áp dụng cho tổ chức; cá nhân chịu 1/2 mức phạt tương ứng.

+ Dù không thiếu thuế, doanh nghiệp vẫn phải nộp bổ sung hồ sơ khai thuế GTGT đầy đủ, đảm bảo kê khai thuế minh bạch và chính xác.

5. Kết luận

Việc nộp lại tờ khai thuế GTGT đúng pháp luật giúp doanh nghiệp vừa tuân thủ quy định của cơ quan thuế vừa bảo vệ quyền lợi tài chính. Để được hướng dẫn chi tiết về kê khai thuế GTGT, nộp tờ khai bổ sung, doanh nghiệp có thể liên hệ trực tiếp với Dịch vụ Kế toán ANTA – đơn vị uy tín, chuyên nghiệp trong lĩnh vực kế toán, thuế, giúp bạn:

+ Khai bổ sung hồ sơ thuế GTGT nhanh chóng, chính xác;

+ Tối ưu thuế GTGT đầu vào, đầu ra;

+ Giảm rủi ro bị xử phạt vi phạm hành chính;

+ Nhận tư vấn cập nhật luật thuế mới nhất 2025.

6. Câu hỏi thường gặp (FAQ)

Câu 1: Nộp tờ khai thuế GTGT bổ sung có bị phạt không?

Không, nếu doanh nghiệp khai bổ sung kịp thời và tự giác nộp đủ số thuế trước khi cơ quan thuế phát hiện sai sót hoặc công bố quyết định kiểm tra, thanh tra.

Câu 2: Thời hạn nộp bổ sung hồ sơ khai thuế GTGT là bao lâu?

Doanh nghiệp được nộp trong vòng 10 năm kể từ ngày hết hạn nộp hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế có sai sót, miễn là chưa thuộc phạm vi thanh tra, kiểm tra.

Câu 3: Khai sai hồ sơ nhưng không thiếu thuế thì mức phạt thế nào?

Mức phạt đối với tổ chức từ 500.000 – 1.500.000 đồng, cá nhân chịu 1/2 mức phạt, đồng thời phải khai lại hồ sơ và nộp bổ sung các chứng từ liên quan.

Câu 4: Hồ sơ khai bổ sung cần những gì?

Tờ khai bổ sung;

Bản giải trình và các tài liệu liên quan;

Với hàng hóa xuất nhập khẩu, thực hiện theo quy định của pháp luật hải quan.

Câu 5: Làm sao để kê khai thuế GTGT chính xác và tránh bị phạt?

Rà soát số liệu đầu vào, đầu ra;

Khai bổ sung kịp thời khi phát hiện sai sót;

Lưu giữ chứng từ đầy đủ để cơ quan thuế kiểm tra nếu cần.

Bài viết cùng chủ đề